Programme

	Lun. 16	Mar. 17
09:00 10:00 11:00 12:00 13:00 14:00 15:00 16:00 17:00	Connexion des participant.e.s + Introduction du GdR EcoStat 9:15 - 9:30 (15min) Connexion des participant.e.s + Introduction du GdR EcoStat Stéphane Dray (CNRS/LBBE) L'équation "AI+ML+DL+CV+ecology = imaginecology" 9:30 - 10:00 (30min) L'équation "AI+ML+DL+CV+ecology = imaginecology" Vincent Miele (CNRS / LBBE) Deep Learning : les bases 10:00 - 10:30 (30min) Deep Learning : les bases Vincent Miele (CNRS / LBBE) Deep Learning : le vocabulaire technique 10:30 - 11:00 (30min) Deep Learning : le vocabulaire technique Vincent Miele (CNRS / LBBE) Deep Learning en action : premier code avec le package R/Python Keras 11:00 - 11:30 (30min) Deep Learning en action : premier code avec le package R/Python Keras Vincent Miele (CNRS / LBBE) Accueil et détails techniques 13:20 - 13:30 (10min) Accueil et détails techniques Le GdR EcoStat ouvrira le bal. Nous rappelerons les règles : 1/ webcam et micro fermés, 2/ questions possibles depuis le chat et 3/ chat ouvert pour toutes les discussions privées entre les participant.e.s. Deep Learning et Pl@ntNet 13:30 - 14:00 (30min) Deep Learning et Pl@ntNet Alexis Joly (INRIA/LIRMM) Deep Learning et sciences de l'environnement 14:00 - 14:30 (30min) Deep Learning et sciences de l'environnement Cedric Pradalier (GeorgiaTech Lorraine/DREAM) Pause café 14:30 - 14:45 (15min) Pause café Session thématique 14:45 - 15:30 (45min) Session thématique Chair: Sakina-Dorothée Ayata (Sorbonne Université/LOV) › Long-term plankton dynamics in freshwater mesocosms - 14:45-14:50 (05min) › Reconnaissance automatique de plancton - Marco Baity-Jesi, Swiss Federal Insitute of Aquatic Science and Technology [Dübendorf] 14:50-14:55 (05min) › Le deep learning comme extracteur de caractéristiques morphologiques pertinentes pour l'écologie - JEan-Olivier Irisson, Sorbonne Université, CNRS, Laboratoire d'Océanographie de Villefranche (LOV), Chemin du Lazaret, 06230 Villefranche-sur-Mer, France - Sakina-Dorothée Ayata, Laboratoire dócéanographie de Villefranche 14:55-15:00 (05min) › Extraction et mesure de traits fonctionnels par apprentissage profond - Frédéric Maps, Département de Biologie, Université Laval 15:00-15:05 (05min) › Utilisation d'images microscopiques artificielles en complément d'images réelles pour la détection automatique de diatomées par apprentissage profond. - Pierre Faure--Giovagnoli, Georgia Tech - CNRS [Metz], Laboratoire dÍnfoRmatique en Image et Systèmes dínformation 15:05-15:10 (05min) › Un projet trans-laboratoire : le projet RAPP : Reconnaissance Automatique du Plancton et Pollens - cristele chevalier, Institut méditerranéen dócéanologie 15:10-15:15 (05min) Session thématique 15:30 - 16:15 (45min) Session thématique Chair: Oliviez Gimenez (CNRS/CEFE) › Camera trap CREA - Marjorie Bison, Centre de Recherches sur les Ecosystèmes dÁltitude 15:30-15:35 (05min) › L'utilisation des pièges photographiques pour estimer l'abondance des populations d'ongulés - 15:35-15:40 (05min) › Lectures de bagues d'oiseaux à partir de pièges photographiques - Jocelyn Champagnon, Institut de recherche de la Tour du Valat 15:40-15:45 (05min) › Mes premiers pas en analyse d'images via deep learning - Retours d'expérience sur l'identification d'espèces animales par piégeage photographique - Olivier Gimenez, Centre d'Ecologie Fonctionnelle et Evolutive 15:45-15:50 (05min) › Un démonstrateur de suivi automatisé des Lépidoptères nocturnes - 15:50-15:55 (05min) › Utilisation de techniques d'intelligence artificielle pour la détection d'animaux en forêt - Bernard BENET, Technologies et systèmes dínformation pour les agrosystèmes 15:55-16:00 (05min) Pause café 16:15 - 16:30 (15min) Pause café Deep learning & camera traps 16:30 - 17:00 (30min) Deep learning & camera traps Sara Beery (CalTech USA)	Deep Learning et acoustique 9:30 - 10:00 (30min) Deep Learning et acoustique Hervé Glotin (Univ. Toulon/LIS) Deep Learning et caméras sonar 10:00 - 10:30 (30min) Deep Learning et caméras sonar Guglielmo Fernandez Garcia (INRAE/ESE) Pause café 10:30 - 10:45 (15min) Pause café Session thématique 10:45 - 11:20 (35min) Session thématique Chair: Olivier Dezerald (INRAE/ESE) › Algorithmes pour la détection et l'identification des poissons sur des vidéos sous-marines - Sébastien Villéger, Laboratoire Biodiversité Marine et ses Usages 10:45-10:50 (05min) › Outils Numériques pour Estimer la Biodiversité à l'Interface aquatique-Terrestre (ONEBIT). - Sami Jaballah, Écologie et santé des écosystèmes, 35042 Rennes, France - François Martignac, Écologie et santé des écosystèmes, 35042 Rennes, France, Pôle OFB,INRAE, Agrocampus Ouest, UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, 35042 Rennes, France - Olivier Dezerald, Écologie et santé des écosystèmes, 35042 Rennes, France 10:50-10:55 (05min) › Deep learning et réseaux sociaux pour la détection de la mégafaune marine rare - Laura Mannocci, MARine Biodiversity Exploitation and Conservation, Ecologie marine tropicale des océans Pacifique et Indien, Laboratoire d'Informatique, de Robotique et de Microélectronique de Montpellier 10:55-11:00 (05min) › Analyse d'images des écosystèmes profonds - catherine borremans, IFREMER- Département Etude des Ecosystèmes Profonds 11:00-11:05 (05min) › Rôle de l'imagerie sous-marine et enjeux de l'automatisation pour l'écologie benthique côtière - Martin Marzloff, IFREMER- Dynamiques de l'Environnement Côtier 11:05-11:10 (05min) Session thématique 11:20 - 12:00 (40min) Session thématique Chair: François Martignac (INRAE/ESE) › Description du paysage acoustique sous-marin - Benjamin Ollivier, Shom 11:20-11:25 (05min) › Comptage automatique des anguilles durant leur période de migration via une caméra acoustique - Azénor Le Quinio, EDF R&D / LNHE 11:25-11:30 (05min) › Traitement et analyse de données acoustiques et vidéos de drone pour l'étude du comportement de dauphins en réponse à des signaux acoustiques - Bastien MERIGOT, UMR MARBEC - MARine Biodiversity Exploitation and Conservation 11:30-11:35 (05min) › Estimating ungulate foraging using deep-learning and audiologger data - Simon Chamaillé-Jammes, Centre d'Ecologie Fonctionnelle et Evolutive 11:35-11:40 (05min) › Utilisation du deep learning pour identifier automatiquement les comportements en mer des tortues marines - Lorène Jeantet, Département Ecologie, Physiologie et Ethologie 11:40-11:45 (05min) Mesurer la ressemblance avec le Deep Learning 13:30 - 14:00 (30min) Mesurer la ressemblance avec le Deep Learning Julien Renoult (CNRS/CEFE) Bonnes pratiques en Deep Learning 14:00 - 14:30 (30min) Bonnes pratiques en Deep Learning Sébastien Lefèvre (Université Bretagne Sud/IRISA) Pause café 14:30 - 14:45 (15min) Pause café Session thématique 14:45 - 15:30 (45min) Session thématique Chair: Julien Renoult (CNRS/CEFE) › Deep-Learning pour la reconnaissance d'instectes - Jean Cohen, Centre dÉcologie et des Sciences de la COnservation 14:45-14:50 (05min) › ECONECT: Développement de systèmes sentinelles de l'environnement connectés pour mieux comprendre la dégradation des cours d'eau, le déclin des abeilles et des oiseaux - maxime cauchoix, SETE - Arnaud Elger, ECOLAB 14:50-14:55 (05min) › identification espèce sur image de piège photo - Claude Miaud, Centre d'Ecologie Fonctionnelle et Evolutive 14:55-15:00 (05min) › Photo identification du Crapaud vert (Bufotes viridis) ; le deep learning est-il une solution plus efficace que les méthodes actuelles ? - Antonin Conan, Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien - Lorène Jeantet, Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien 15:00-15:05 (05min) › Application de l'intelligence artificielle à l'étude de l'apprentissage et de l'évolution du dessin chez les Hominidés - Benjamin BELTZUNG, Institut Pluridiscplinaire Hubert Curien (UMR7178) 15:05-15:10 (05min) Session thématique 15:30 - 16:00 (30min) Session thématique Chair: Guglielmo Fernandez-Garcia (INRAE/ESE) › Données de télédétection multi-échelle & Apprentissage profond pour la caractérisation d'hydropériode en prairie humide - Emilien Alvarez-Vanhard - Littoral, Environnement, Télédétection, Géomatique UMR 6554 15:30-15:35 (05min) › Détection d'espèces végétales à partir de relevés photogrammétriques - Fabrice Vinatier, Laboratoire d\'étude des Interactions Sol - Agrosystème - Hydrosystème 15:35-15:40 (05min) › Intelligence Artificielle et Stratégies de Recherche Alimentaire d'Oiseaux Marins - Amédée Roy, MARine Biodiversity Exploitation and Conservation 15:40-15:45 (05min) › Segmentation supervisée sur des images multispectrales - Jérôme Mathieu - Institut d\'écologie et des sciences de lénvironnement de Paris 15:45-15:50 (05min) Et maintenant, qu'est qu'on fait ? Besoins, idées, structuration ? avec le GdR EcoStat 16:00 - 16:30 (30min) Et maintenant, qu'est qu'on fait ? Besoins, idées, structuration ? avec le GdR EcoStat Discussion collective Cocktail (eh non, malheureusement... nous nous rattraperons) 16:30 - 17:00 (30min) Cocktail (eh non, malheureusement... nous nous rattraperons)

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